| 施行日 | 市町村名 | 統合形態 | 新呼称 |
|---|---|---|---|
| 2006. 3.31 | 東国東郡国見町・国東町・武蔵町・安岐町 | 合併 | 国東市 |
| 2005.10. 1 | 杵築市・速見郡山香町・西国東郡大田村 | 合併 | 杵築市 |
| 2005.10. 1 | 大分郡挾間町・庄内町・湯布院町 | 合併 | 由布市 |
| 2005. 4. 1 | 竹田市・直入郡荻町・久住町・直入町 | 合併 | 竹田市 |
| 2005. 3.31 | 宇佐市・宇佐郡院内町・安心院町 | 合併 | 宇佐市 |
| 2005. 3.31 | 大野郡三重町・清川村・緒方町・朝地町 ・大野町・千歳村・犬飼町 | 合併 | 豊後大野市 |
| 2005. 3.31 | 豊後高田市・西国東郡真玉町・香々地町 | 合併 | 豊後高田市 |
| 2005. 3.22 | 日田郡前津江村・中津江村・上津江村・大山町 ・天瀬町 | 日田市へ編入 | 日田市 |
| 2005. 3. 3 | 佐伯市・南海部郡上浦町・弥生町・本匠村 ・宇目町・直川村・鶴見町・米水津村・蒲江町 | 合併 | 佐伯市 |
| 2005. 3. 1 | 下毛郡三光村・本耶馬渓町・耶馬渓町・山国町 | 中津市へ編入 | 中津市 |
| 2005. 1. 1 | 臼杵市・大野郡野津町 | 合併 | 臼杵市 |
| 2005. 1. 1 | 大分郡野津原町・北海部郡佐賀関町 | 大分市へ編入 | 大分市 |
